奈落是妖怪和鬼蜘蛛之心的结合体，妖怪们一向憎恨桔梗这个巫女，而鬼蜘蛛对桔梗大约是爱。
可以那么说奈落对桔梗是又爱又恨又怕。
被创造出来，鬼蜘蛛的心被妖怪们对桔梗的恨压制，所以奈落直接暗中设计犬夜叉和桔梗误以为遭到对方的背叛，导致桔梗将犬夜叉封印，而她带着四魂之玉一起火化。
以上，是桔梗，犬夜叉和奈落的渊源，还未到主剧情。
主剧情。
五百年后，桔梗的灵魂转世为现代少女日暮戈薇，戈薇带着四魂之玉意外通过家中的食骨之井穿越到妖怪横行的战国时代。
后来，戈薇解开了犬夜叉的封印，无意间射碎四魂之玉，使其破碎成残片，散落于各地。
四魂之玉的碎片一旦被妖怪得到，妖怪将会妖力大增，被污秽侵蚀，为了搜集齐所有的四魂之玉碎片，犬夜叉和戈薇在弥勒、珊瑚、七宝还有云母等一众伙伴的陪同下开始了旅途。
在中间，桔梗意外被一个鬼女里陶复活，得回了一小部分灵魂。
虽然复活了，但她的身体不过是陶土和墓土制成的身体。
由于灵魂不完整，桔梗的身体需要填满死魂才能行动，所以身边一直跟随着帮其搜集死魂的死魂虫。
一开始，不知道真相，桔梗对犬夜叉又爱又恨，想拉他和自己一起死。
后来，桔梗知道当年真相，计划让奈落收集完所有的四魂之玉在直接将四魂之玉和奈落一起净化。
在收集四魂之玉碎片的过程中，犬夜叉和戈薇感情升温，但他也知道了当年的真相，本就爱桔梗的他更是放不下，一时之间，他在两个人之间摇摆不定。
可每一次，不等他做出选择，桔梗都转身离去，她的身边，永远都是死魂虫和星空。
后来，傲娇的奈落为了逃避自己不爱桔梗的事实，将她害死，可即使死在奈落手上，桔梗也在即将完整的四魂之玉上留下了一点光亮。
剧情的最后。
在最后一战里。
戈薇问奈落：“其实，四魂之玉没有真的实现你的愿望吧，奈落。”
在四魂之玉净化化为碎片的瞬间。
奈落说了那么一句话。
他说——
我真正的愿望，只不过是为了得到桔梗的心而已。
在他消失的时候。
他又说——